Bank gambar pankreas diharapkan dapat membantu memajukan penelitian diabetes di seluruh dunia

Bank gambar pankreas diharapkan dapat membantu memajukan penelitian diabetes di seluruh dunia

Sebuah bank gambar ekstensif sampel pankreas dari anak-anak yang menderita diabetes sesaat sebelum kematian telah ditayangkan di Vanderbilt University Medical Center.

University of Exeter dan Vanderbilt University Medical Center (VUMC) bekerja sama untuk membuat gambar resolusi tinggi dari jaringan pankreas tersedia di Pancreatlas, database pencitraan on-line pertama di dunia dari jaringan pankreas manusia yang dibuat dan disimpan di VUMC.

Menurut para peneliti, gambar kembali adalah aset berharga karena pankreas manusia tidak dapat dibiopsi dengan aman, dan studi tentang perubahan seluler yang menyebabkan diabetes tipe 1 hanya dapat dilakukan pada spesimen pankreas dari individu dengan penyakit setelah kematian mereka.

Exeter Archival Diabetes Biobank (EADB) mencakup 345 gambar jaringan post-mortem yang diperoleh oleh mantan profesor Universitas Glasgow Alan Foulis pada 1980-an.

Gambar-gambar ini mewakili koleksi sampel pankreas terbesar yang ditemukan dari orang-orang yang meninggal tak lama setelah diagnosis diabetes tipe 1.

Alan Foulis mewariskan koleksi jaringan ke Fakultas Kedokteran Universitas Exeter setelah pensiun dan spesimen kemudian didigitalkan oleh Profesor Peter In’t Veld dari Vrije Universiteit Brussel.

Kurator koleksi, profesor Exeter Dr Noel Morgan dan Dr Sarah Richardson menghubungi pencipta Pancreatlas untuk melihat apakah gambar dapat ditambahkan ke database online dan tersedia bagi siapa saja di dunia. Profesor Exeter kemudian memfasilitasi transfer gambar.

Dr Diane Saunders berkata: “Kami sangat senang bahwa arsip yang tak ternilai ini sekarang dapat diakses oleh para penyelidik di seluruh dunia melalui platform Pancreatlas.

“Ini bukan hanya kelompok sampel yang unik, tetapi Exeter Archival Diabetes Biobank telah memungkinkan kemajuan mendasar dalam penelitian pankreas manusia, termasuk profil insulitis dan bukti keterlibatan virus dalam mendorong autoimunitas sel beta di tingkat pulau kecil.”

Dia menambahkan: “Ini adalah harapan kami bahwa gambar-gambar ini akan terus memacu penemuan ilmiah sebagai peneliti bekerja untuk mengungkap perkembangan diabetes tipe 1.”

345 gambar EADB mewakili 189 donor berbeda mulai dari usia tiga bulan hingga 17 tahun. Timbulnya diabetes tipe 1 berkisar dari beberapa hari setelah kematian mereka hingga durasi 19 tahun. Gambar adalah bagian jaringan yang diwarnai menggunakan hematoxylin dan eosin (H&E) atau dengan imunohistokimia yang menargetkan biomarker protein ke hormon dan protein pensinyalan lainnya.

Profesor Noel Morgan berkata: “Untungnya, kebanyakan orang tidak mati sampai lama setelah diagnosis diabetes tipe 1, tetapi ini berarti bahwa ketersediaan organ di mana proses penyakit masih aktif sangat jarang.

“Akibatnya, sangat sedikit orang di seluruh dunia yang mempelajari diabetes tipe 1 yang mampu mempelajari jaringan dari anak kecil dengan diabetes tipe 1 yang baru muncul.”

Dia menambahkan: “Penyediaan catatan EADB unik ini melalui Pancreatlas adalah perkembangan besar karena menyediakan akses mudah ke audiens global dan menetapkan koleksi ini dalam konteks koleksi gambar pankreas sangat penting lainnya yang tersedia di situs.

“Kriteria pencarian dan sistem anotasi yang dikembangkan oleh tim Vanderbilt memungkinkan peneliti untuk memilih gambar yang paling relevan dengan studi mereka sendiri dan untuk melihatnya dalam resolusi tinggi dari meja mereka sendiri.”

Secara total, Pancreatlas saat ini menampung 2.180 gambar, mewakili beberapa biobank dan inisiatif penelitian. Situs ini menyediakan akses komunitas ilmiah ke gambar beranotasi jaringan pankreas manusia dan karakteristik donor terkait dengan harapan memajukan pemahaman penyakit seperti diabetes, kanker pankreas, dan pankreatitis.

Basis data gambar online dirancang berdasarkan prinsip otomatisasi dan skalabilitas serta kemudahan penggunaan. Gambar dikelompokkan ke dalam koleksi yang dikuratori untuk memudahkan eksplorasi topik atau status penyakit tertentu, atau sebagai alternatif, pengguna dapat mencari gambar yang menarik di semua koleksi.

Menu penyaringan memungkinkan pengguna untuk melihat dan memperbaiki gambar berdasarkan informasi eksperimental (misalnya, pemrosesan jaringan, biomarker yang divisualisasikan) serta rincian klinis (misalnya, status dan durasi penyakit).

Kumpulan data gambar yang komprehensif dari seluruh umur manusia juga disertakan dalam Pancreatlas untuk memberikan konteks bagi para peneliti yang bekerja, misalnya, untuk memahami bagaimana perkembangan pankreas dapat berhubungan dengan perkembangan diabetes atau asal-usul kanker pankreas.

Pancreatlas dikembangkan oleh Saunders, Marcela Brissova, PhD, profesor riset Kedokteran, dan Jean-Philippe Cartailler, PhD, di Vanderbilt, dengan dukungan dari The Leona M. dan Harry B. Helmsley Charitable Trust, Program Analisis Pankreas Manusia sebagai bagian dari Jaringan Penelitian Pulau Manusia, (DK104211, DK108120, DK112232, DK106755, DK120456), Pusat Diabetes Vanderbilt dan Pusat Penelitian dan Pelatihan Diabetes Vanderbilt (DK20593).

Author: Henry Kelly